Tato diplomová práce se zabývá vývojem molekulárních markerů pro chromozom W u modráska Polyommatus icarus, u kterého byly nalezeny karyotypové rasy lišící se konstitucí neo-pohlavních chromozomů. Vyvinuté markery byly použity pro určení pohlaví pomocí PCR u čerstvě vylíhlých housenek, ze kterých byla izolována celková RNA, která bude dále použita pro testování role pohlavně antagonistické selekce ve fixaci neo-pohlavních chromozomů.
Annotation in English
This thesis focuses on development of molecular markers for the W chromosome in the blue butterfly Polyommatus icarus. In this blue butterfly, karyotype races with different constitution of the neo-sex chromosomes were reported. The markers were used for PCR sexing of the early developmental stages to obtain sex-specific total RNA samples for testing a role of sexually antagonistic selection in fixation of neo-sex chromosomes.
Tato diplomová práce se zabývá vývojem molekulárních markerů pro chromozom W u modráska Polyommatus icarus, u kterého byly nalezeny karyotypové rasy lišící se konstitucí neo-pohlavních chromozomů. Vyvinuté markery byly použity pro určení pohlaví pomocí PCR u čerstvě vylíhlých housenek, ze kterých byla izolována celková RNA, která bude dále použita pro testování role pohlavně antagonistické selekce ve fixaci neo-pohlavních chromozomů.
Annotation in English
This thesis focuses on development of molecular markers for the W chromosome in the blue butterfly Polyommatus icarus. In this blue butterfly, karyotype races with different constitution of the neo-sex chromosomes were reported. The markers were used for PCR sexing of the early developmental stages to obtain sex-specific total RNA samples for testing a role of sexually antagonistic selection in fixation of neo-sex chromosomes.
Oponenti: prof. RNDr. František Marec, CSc., doc. Mgr. Radka Symonová, Ph.D.
Komisia: Mgr. Lenka Chodáková, Ph.D. sa ospravedlnila.
Študentka prezentovala svoju prácu v štandardnom čase.
Školiteľ prečítal svoj posudok a bol spokojný s Monikou a jej prácou v laboratóriu, študentka bude pokračovať do doktorského štúdia.
Obaja oponenti prečítali svoj posudok a zhodli sa, že práca bola veľmi vydarená a boli spokojní ako s formálnou, tak aj obsahovou časťou práce. Diskusia so študenkou prebehla k ich spokojnosti.
Následne bola otvorená diskusia s komisiou:
Mgr. Iva Mozgová, Ph.D.: Detekce k-merů specifických u samic v repeticích a jejich vizualizace pomocí FISH
doc. Hassan Hashimi, Ph.D.: Vznik nespecifických produktů při použití určitých kombinací nukleotidů, jejich vliv na interpretaci výsledků a odstranění pomocí optimalizace PCR.
Mgr. Aleš Horák, Ph.D.: Parametry genové assembly z Oxford Nanopore dat a jejich případná korekce pomocí Illumina PE150 čtení.
