U vybraných linií šlechtitelského programu DOMINANT CZ - Rhode Island Red (RIR), New Hampshire (NH) a finálních hybridů RIRxNH a NHxRIR, byl zkoumán gen kuřecího růstového hormonu. Analýza PCR - RFLP odhalila tři MspI štěpná místa na intronu 1. Tato štěpná místa poskytovala fragmenty o délce 540 bp, 390 bp, 270 bp, 240 bp, 150 bp a 120 bp. Na základě restrikčních vzorů byly ve sledovaných populacích popsány tři alely genu růstového hormonu. Z možných šesti genotypů byly nalezeny pouze čtyři. V linii RIR je nejvíce zastoupena alela A1 s frekvencí výskytu 0,925, u NH převažuje alela A3 s frekvencí výskytu 0,550. U finálních hybridů RIRxNH a NHxRIR převažují kříženci s alelou A1.
Anotace v angličtině
Chicken growth hormone gene was examined in chosen strains from DOMINANT CZ breeding program - Rhode Island Red (RIR), New Hampshire (NH) and the final hybrids RIRxNH and NHxRIR. Polymerase chain reaction - restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) analyses reveal three MspI restriction sites of intron 1 region. These restriction sites give rise to six RFLP fragments - 540 bp, 390 bp, 270 bp, 240 bp, 150 bp, 120 bp. Based on restriction patterns, three alleles of growth hormone were determined. From a possible six genotypes, only four were found in all populations. The allele A1 is the most abundant in RIR strain (0.925), allele A3 is the most abundant in NH strain (0.550). The allele A1 was present in the most of the hybrids.
Klíčová slova
Polymorfismus, Růstový hormon, MspI, PCR-RFLP, Rhode Island Red (RIR), New Hampshire (NH).
Klíčová slova v angličtině
Polymorphism, Growth hormone, MspI, PCR-RFLP, Rhode Island Red (RIR), New Hampshire (NH).
Rozsah průvodní práce
25
Jazyk
CZ
Anotace
U vybraných linií šlechtitelského programu DOMINANT CZ - Rhode Island Red (RIR), New Hampshire (NH) a finálních hybridů RIRxNH a NHxRIR, byl zkoumán gen kuřecího růstového hormonu. Analýza PCR - RFLP odhalila tři MspI štěpná místa na intronu 1. Tato štěpná místa poskytovala fragmenty o délce 540 bp, 390 bp, 270 bp, 240 bp, 150 bp a 120 bp. Na základě restrikčních vzorů byly ve sledovaných populacích popsány tři alely genu růstového hormonu. Z možných šesti genotypů byly nalezeny pouze čtyři. V linii RIR je nejvíce zastoupena alela A1 s frekvencí výskytu 0,925, u NH převažuje alela A3 s frekvencí výskytu 0,550. U finálních hybridů RIRxNH a NHxRIR převažují kříženci s alelou A1.
Anotace v angličtině
Chicken growth hormone gene was examined in chosen strains from DOMINANT CZ breeding program - Rhode Island Red (RIR), New Hampshire (NH) and the final hybrids RIRxNH and NHxRIR. Polymerase chain reaction - restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) analyses reveal three MspI restriction sites of intron 1 region. These restriction sites give rise to six RFLP fragments - 540 bp, 390 bp, 270 bp, 240 bp, 150 bp, 120 bp. Based on restriction patterns, three alleles of growth hormone were determined. From a possible six genotypes, only four were found in all populations. The allele A1 is the most abundant in RIR strain (0.925), allele A3 is the most abundant in NH strain (0.550). The allele A1 was present in the most of the hybrids.
Klíčová slova
Polymorfismus, Růstový hormon, MspI, PCR-RFLP, Rhode Island Red (RIR), New Hampshire (NH).
Klíčová slova v angličtině
Polymorphism, Growth hormone, MspI, PCR-RFLP, Rhode Island Red (RIR), New Hampshire (NH).
Zásady pro vypracování
Úkolem diplomantky je metodicky zvládnout analýzu polymorfismu molekulárně genetickými postupy. Bude provedena studie vybraných polymorfních lokusů kura, a to u linií z domácího šlechtění. Budou vyhodnoceny četnosti alel a genotypů s cílem potenciálně stanovit jejich vztah k některým užitkovým vlastnostem.\\
Práce bude členěna do obvyklých kapitol:\\
1) Úvod - přehled literatury, zejména z vědeckých časopisů v angličtině\\
2) Materiál a metodika - popis analyzovaných linií, popis laboratorních metod, použivaných pro genotypizaci\\
3) Výsledky a diskuze - analýza zkoumaných polymorfních lokusů\\
4) Závěr - shrnutí zjištěných výsledků\\
Při zpracování diplomové práce budou doržena obvyklá formální pravidla.
Zásady pro vypracování
Úkolem diplomantky je metodicky zvládnout analýzu polymorfismu molekulárně genetickými postupy. Bude provedena studie vybraných polymorfních lokusů kura, a to u linií z domácího šlechtění. Budou vyhodnoceny četnosti alel a genotypů s cílem potenciálně stanovit jejich vztah k některým užitkovým vlastnostem.\\
Práce bude členěna do obvyklých kapitol:\\
1) Úvod - přehled literatury, zejména z vědeckých časopisů v angličtině\\
2) Materiál a metodika - popis analyzovaných linií, popis laboratorních metod, použivaných pro genotypizaci\\
3) Výsledky a diskuze - analýza zkoumaných polymorfních lokusů\\
4) Závěr - shrnutí zjištěných výsledků\\
Při zpracování diplomové práce budou doržena obvyklá formální pravidla.
Seznam doporučené literatury
Hennig, W. (2002): Genetik. Springer, 853 pp.\\
Nicholl, D.S.T. (2002): An Introduction to Genetic Engineering. Cambridge University Press, 292 pp.\\
Rosypal, Š. (1996): Úvod do molekulární biologie I, II, doplněk. Vlastním nákladem, Brno.\\
Kuhnlein, U., Ni, L., Weigend, S., Gavora, J. S., Fairfull, W., Zadworny, D. (1997): DNA polymorphism in the chicken growth hormone gene:response to selection for disease resistance and association with egg production. Animal Genetics, 28, 116-123.\\
Seznam doporučené literatury
Hennig, W. (2002): Genetik. Springer, 853 pp.\\
Nicholl, D.S.T. (2002): An Introduction to Genetic Engineering. Cambridge University Press, 292 pp.\\
Rosypal, Š. (1996): Úvod do molekulární biologie I, II, doplněk. Vlastním nákladem, Brno.\\
Kuhnlein, U., Ni, L., Weigend, S., Gavora, J. S., Fairfull, W., Zadworny, D. (1997): DNA polymorphism in the chicken growth hormone gene:response to selection for disease resistance and association with egg production. Animal Genetics, 28, 116-123.\\