The aim of this bachelor thesis was a crystallization of serpin Iripin-5 from ticks Ixodes ricinus. Iripin-5 is the most produced serpin in the salivary glands of ticks. The focus of this thesis was to prepare protein Iripin-5 and perform crystallization experiments. Obtained crystals of Iripin-5 were in diffraction quality.
The aim of this bachelor thesis was a crystallization of serpin Iripin-5 from ticks Ixodes ricinus. Iripin-5 is the most produced serpin in the salivary glands of ticks. The focus of this thesis was to prepare protein Iripin-5 and perform crystallization experiments. Obtained crystals of Iripin-5 were in diffraction quality.
Komise - ve schváleném složení (oponent nepřítomen), obhajoba prezenční.
Průběh:
1. Představení práce studentkou. 2. Posudek školitelky. 3. Posudek oponentky. 4. Odpovědi na dotazy oponenta.
5. Diskuze:
ŠK: Rozdíl serpinu 4 a 5 - mají stejnou mol. hmotnost? Transformace do buněk - jakých? Jaký anex byl použit? Lysozym byl použit na zvládnutí metody? Jak proběhlo zakoncentrování - jakou metodou, a jak výměna pufru?
MKab.: Jaká je podobnost AK složení v serpinu 4 a 5? Proč se zkoumal tento serpin, když struktura je hotová?
JŠ: Lysozym - jak krystalizován (jiná metoda krystalizace)? Iripin chrání před imunitní reakcí hostitele - jak? Proč používala obrázky převzaté a ne vyfotografované použité zařízení? Hmotnostní spektrometrie - malé zastoupení v prezentaci (studentka zdůvodňuje, že neprováděla).Co bylo dáno na krystalizaci - z čeho vznikly krystaly (která frakce byla použita na krystalizaci).
M Kutý: Jak časově náročná byla krystalizace a jaké rozměry krystalu?
Známky: Jednou výborně, třikrát velmi dobře, výsledek velmi dobře. Hlasovací lístky uloženy na studijním oddělení