Diplomová práce shrnuje poznatky o významných geneticky podmíněných chorobách vyskytujících se u border kolií. Je zde popsáno celkem 14 chorob, některé s doposud neznámou lokací kauzální mutace. Primárním zaměřením této práce byla g.4411956_4411960delGTTT mutace genu VPS13B způsobující syndrom uvězněných neutrofilů (TNS), mutace AF045016.1: c.227_230delATAG genu MDR1 spojená s mnohočetnou lékovou rezistenci (MDR1) a mutace c.8392delC genu CUBN která zapříčiňuje střevní malabsorbci kobalaminu neboli Imerslund-Gräsbeckův syndrom (IGS). Byl proveden rozbor genotypů u 89 border kolií s průkazem původu. DNA byla získána stěry bukální sliznice, izolace byla provedena z nativního materiálu Chelexem-100. Analýza probíhala optimalizovanou metodou PCR-RFLP za použití restrikčních enzymů MboI (MDR1) a Msl I (IGS). Ve sledovaném vzorku byli zjištěni čtyři přenašeči g.4411956_4411960delGTTT mutace zapříčiňující TNS. Pro MDR1 a IGS byly detekování pouze nepostižení jedinci.
Anotace v angličtině
This diploma thesis summarizes knowledge of significant genetically contitioned deseases occurring in border collies. There is described a total of 14 diseases, some with the location of causal mutation not yet known. Primary focus of this thesis is g.4411956_4411960delGTTT mutation of gene VPS13B causing Trapped Neuthrophil Syndrome (TNS), MDR1 gene's mutation AF045016.1: c.227_230delATAG associated with multidrug resistance (MDR1) and CUBN gene's mutation c.8392delC which causes intestinal malabsorption of cobalamin by another name ImerslundGräsbeck syndrome (IGS). A genotype analysis of 89 border collies with a proof of origin was performed. The DNA was extracted from buccal mucosal swabs, the isolation of DNA was performed by Chelex-100 from the native material. The analysis was proceeded by optimized PCR-RFLP method using restrictive MboI (MDR1) and Msl I (IGS) enzymes. There were detected 4 g.4411956_4411960delGTTT mutation vectors causing TNS. As for the MDR1 and IGS there wasn't detected any affected case.
Hereditary diseases of dogs, trapped neuthrophil syndrome, multidrug resistance, intestinal malabsorption of cobalamin, ImerslundGräsbeck syndrome, border collie
Rozsah průvodní práce
66
Jazyk
CZ
Anotace
Diplomová práce shrnuje poznatky o významných geneticky podmíněných chorobách vyskytujících se u border kolií. Je zde popsáno celkem 14 chorob, některé s doposud neznámou lokací kauzální mutace. Primárním zaměřením této práce byla g.4411956_4411960delGTTT mutace genu VPS13B způsobující syndrom uvězněných neutrofilů (TNS), mutace AF045016.1: c.227_230delATAG genu MDR1 spojená s mnohočetnou lékovou rezistenci (MDR1) a mutace c.8392delC genu CUBN která zapříčiňuje střevní malabsorbci kobalaminu neboli Imerslund-Gräsbeckův syndrom (IGS). Byl proveden rozbor genotypů u 89 border kolií s průkazem původu. DNA byla získána stěry bukální sliznice, izolace byla provedena z nativního materiálu Chelexem-100. Analýza probíhala optimalizovanou metodou PCR-RFLP za použití restrikčních enzymů MboI (MDR1) a Msl I (IGS). Ve sledovaném vzorku byli zjištěni čtyři přenašeči g.4411956_4411960delGTTT mutace zapříčiňující TNS. Pro MDR1 a IGS byly detekování pouze nepostižení jedinci.
Anotace v angličtině
This diploma thesis summarizes knowledge of significant genetically contitioned deseases occurring in border collies. There is described a total of 14 diseases, some with the location of causal mutation not yet known. Primary focus of this thesis is g.4411956_4411960delGTTT mutation of gene VPS13B causing Trapped Neuthrophil Syndrome (TNS), MDR1 gene's mutation AF045016.1: c.227_230delATAG associated with multidrug resistance (MDR1) and CUBN gene's mutation c.8392delC which causes intestinal malabsorption of cobalamin by another name ImerslundGräsbeck syndrome (IGS). A genotype analysis of 89 border collies with a proof of origin was performed. The DNA was extracted from buccal mucosal swabs, the isolation of DNA was performed by Chelex-100 from the native material. The analysis was proceeded by optimized PCR-RFLP method using restrictive MboI (MDR1) and Msl I (IGS) enzymes. There were detected 4 g.4411956_4411960delGTTT mutation vectors causing TNS. As for the MDR1 and IGS there wasn't detected any affected case.
Hereditary diseases of dogs, trapped neuthrophil syndrome, multidrug resistance, intestinal malabsorption of cobalamin, ImerslundGräsbeck syndrome, border collie
Zásady pro vypracování
Mutace v genu MDR1 (multidrug resistence gene) je u psů asociována s přecitlivělostí na určité druhy léků. Mutace způsobuje náchylnost zvířete k potenciálně smrtelné neurotoxicitě.
Syndrom uvězněných neutrofilů (TNS; Trapped Neutrophil Syndrome) je způsoben delecí čtyř párů bází GTTT v exonu 19 genu VPS13B, která má za následek předčasné zařazení stop kodonu během translace. Mutace vede k narušení
správné funkce neutrofilů.
Imerslund-Gräsbeck syndrom (IGS; střevní malabsorpce kobalaminu) je geneticky podmíněná metabolická porucha, charakterizovaná zejména neutropenií, snížením hladiny kobalaminu v krevním séru a neregenerativní anémií.
U border kolií je způsobena mutací v genu CUBN (cubilin), která vede k malabsorpci kobalaminu střevní sliznicí.
Cílem diplomové práce je zpracovat literární přehled sumarizující dosavadní poznatky o uvedených geneticky podmíněných chorobách a analyzovat genotypy u souboru vzorků odebraných od jedinců plemene border kolie.
DNA bude izolována ze stěrů z bukální sliznice. Analýza mutace genů bude prováděna metodou PCR-RFLP. V literární rešerši shrňte dosavadní poznatky o jmenovaných dědičně podmíněných chorobách. Ze vzorků biologického
materiálu vyizolujte DNA a po její amplifikaci proveďte restrikční analýzu. Vyhodnoťte jednotlivé genotypy příslušných genů u souboru zvířat. Proveďte analýzu genetické struktury populace.
Zásady pro vypracování
Mutace v genu MDR1 (multidrug resistence gene) je u psů asociována s přecitlivělostí na určité druhy léků. Mutace způsobuje náchylnost zvířete k potenciálně smrtelné neurotoxicitě.
Syndrom uvězněných neutrofilů (TNS; Trapped Neutrophil Syndrome) je způsoben delecí čtyř párů bází GTTT v exonu 19 genu VPS13B, která má za následek předčasné zařazení stop kodonu během translace. Mutace vede k narušení
správné funkce neutrofilů.
Imerslund-Gräsbeck syndrom (IGS; střevní malabsorpce kobalaminu) je geneticky podmíněná metabolická porucha, charakterizovaná zejména neutropenií, snížením hladiny kobalaminu v krevním séru a neregenerativní anémií.
U border kolií je způsobena mutací v genu CUBN (cubilin), která vede k malabsorpci kobalaminu střevní sliznicí.
Cílem diplomové práce je zpracovat literární přehled sumarizující dosavadní poznatky o uvedených geneticky podmíněných chorobách a analyzovat genotypy u souboru vzorků odebraných od jedinců plemene border kolie.
DNA bude izolována ze stěrů z bukální sliznice. Analýza mutace genů bude prováděna metodou PCR-RFLP. V literární rešerši shrňte dosavadní poznatky o jmenovaných dědičně podmíněných chorobách. Ze vzorků biologického
materiálu vyizolujte DNA a po její amplifikaci proveďte restrikční analýzu. Vyhodnoťte jednotlivé genotypy příslušných genů u souboru zvířat. Proveďte analýzu genetické struktury populace.
Seznam doporučené literatury
Fyfe J.C., Hemker S.L., Venta P.J., Stebbing B., and Giger U., 2014. Selective Intestinal Cobalamin Malabsorption with Proteinuria (Imerslund-Gräsbeck Syndrome) in Juvenile Beagles. J. Vet. Intern. Med. 28, 356-362.
Geyer J., Döring B., Godoy J.R., Moritz A., Petzinger E., 2005. Development of a PCR-based diagnostic test detecting a nt230(del4) MDR1 mutation in dogs: verification in a moxidectin-sensitive Australian Shepherd. J. Vet. Pharmacol. Therap. 28, 95-99.
Mizukami K., Shoubudani T., Nishimoto S., Kawamura R., Yabuki A., and Yamato O., 2012. Trapped Neutrophil Syndrome in a Border Collie Dog: Clinical, Clinico-Pathologic, and Molecular Findings. J. Vet. Med. Sci. 74(6): 797-800.
Seznam doporučené literatury
Fyfe J.C., Hemker S.L., Venta P.J., Stebbing B., and Giger U., 2014. Selective Intestinal Cobalamin Malabsorption with Proteinuria (Imerslund-Gräsbeck Syndrome) in Juvenile Beagles. J. Vet. Intern. Med. 28, 356-362.
Geyer J., Döring B., Godoy J.R., Moritz A., Petzinger E., 2005. Development of a PCR-based diagnostic test detecting a nt230(del4) MDR1 mutation in dogs: verification in a moxidectin-sensitive Australian Shepherd. J. Vet. Pharmacol. Therap. 28, 95-99.
Mizukami K., Shoubudani T., Nishimoto S., Kawamura R., Yabuki A., and Yamato O., 2012. Trapped Neutrophil Syndrome in a Border Collie Dog: Clinical, Clinico-Pathologic, and Molecular Findings. J. Vet. Med. Sci. 74(6): 797-800.