Tato diplomová práce navazuje na bakalářskou práci a její úkol spočívá
ve zpracování analýzy výskytu PSE masa v populaci českého bílého ušlechtilého plemene jako důsledek kongenitální choroby stresového syndromu prasat. V literárním přehledu práce je uvedena obecná problematika vzniku kongenitálních poruch. Dále práce pojednává o stresovém syndromu prasat a o stresu, jež
se podílí na vzniku vad masa jako vnější činitel. Popsány jsou také molekulárně ? genetické metody, které se používají v praktické části.
Vlastní výzkum se zaměřil na genotypizaci lokusů vybraného panelu vzorků,
na určení frekvence alel a genotypů ve vybraném lokusu a na statistický vztah mezi genotypem a projevem PSE masa. V závěru byly statisticky zpracovány
a vyhodnoceny výsledky.
Anotace v angličtině
This diploma thesis follows the bachelor thesis and it?s task is to processing analysis of the occurrence of PSE meat in a population of the Czech white breed
as a pigs stress syndrome impact. General problem of congenital diseases
is processed in literature review. Further, this work deals with pigs stress syndrome and stress, which causes the meat defects as an external factor. Molecular - genetic methods, which are used in the practical part, are described as well.
The research focused on genotyping of loci selected panel of samples,
to determine the frequency of alleles and genotypes of selected locus and the statistical relationship between genotype and expression of PSE meat. Results were statistically processed and evaluated at the end.
Klíčová slova
kongenitální porucha; stresový syndrom prasat; PCR; RFLP;
gen RYR1; PSE maso
Klíčová slova v angličtině
congenital diseases; stress syndrome of pigs; PCR; RFLP;
RYR1 gene; PSE meat
Rozsah průvodní práce
48 s.
Jazyk
CZ
Anotace
Tato diplomová práce navazuje na bakalářskou práci a její úkol spočívá
ve zpracování analýzy výskytu PSE masa v populaci českého bílého ušlechtilého plemene jako důsledek kongenitální choroby stresového syndromu prasat. V literárním přehledu práce je uvedena obecná problematika vzniku kongenitálních poruch. Dále práce pojednává o stresovém syndromu prasat a o stresu, jež
se podílí na vzniku vad masa jako vnější činitel. Popsány jsou také molekulárně ? genetické metody, které se používají v praktické části.
Vlastní výzkum se zaměřil na genotypizaci lokusů vybraného panelu vzorků,
na určení frekvence alel a genotypů ve vybraném lokusu a na statistický vztah mezi genotypem a projevem PSE masa. V závěru byly statisticky zpracovány
a vyhodnoceny výsledky.
Anotace v angličtině
This diploma thesis follows the bachelor thesis and it?s task is to processing analysis of the occurrence of PSE meat in a population of the Czech white breed
as a pigs stress syndrome impact. General problem of congenital diseases
is processed in literature review. Further, this work deals with pigs stress syndrome and stress, which causes the meat defects as an external factor. Molecular - genetic methods, which are used in the practical part, are described as well.
The research focused on genotyping of loci selected panel of samples,
to determine the frequency of alleles and genotypes of selected locus and the statistical relationship between genotype and expression of PSE meat. Results were statistically processed and evaluated at the end.
Klíčová slova
kongenitální porucha; stresový syndrom prasat; PCR; RFLP;
gen RYR1; PSE maso
Klíčová slova v angličtině
congenital diseases; stress syndrome of pigs; PCR; RFLP;
RYR1 gene; PSE meat
Zásady pro vypracování
Cílem diplomové práce je provést genotypizaci vybraných lokusů, spojených s kongenitálními chorobami prasat, na vybraném panelu vzorků. Analýzy budou provedeny molekulárně-genetickými metodami. V závěru by měl být zhodnocen výskyt vybraných chorob ve zkoumaném souboru zvířat, popř. navrhnout vhodný metodický postup pro zabránění dalšího šíření těchto chorob do následujících populací\\
Práce bude členěna do kapitol: \\
1) úvod \\
2) literární přehled výskytu kongenitálních chorob prasat a principy molekulárně-genetických metod, využívaných při odhalování těchto chorob - převážně z vědeckých článků v anglickém jazyce\\
3) materiál a metodika - popis vybraného panelu zvířat, popis použitých molekulárně-genetických metod\\
4) výsledky a diskuze - analýza zjištěných výsledků genotypizace u jednotlivých lokusů a porovnání získaných výsledků s výsledky jiných autorů\\
5) závěr - shrnutí zjištěných výsledků, formulace praktických doporučení\\
Při zpracování diplomové práce budou dodržena obvyklá formální pravidla.\\
Zásady pro vypracování
Cílem diplomové práce je provést genotypizaci vybraných lokusů, spojených s kongenitálními chorobami prasat, na vybraném panelu vzorků. Analýzy budou provedeny molekulárně-genetickými metodami. V závěru by měl být zhodnocen výskyt vybraných chorob ve zkoumaném souboru zvířat, popř. navrhnout vhodný metodický postup pro zabránění dalšího šíření těchto chorob do následujících populací\\
Práce bude členěna do kapitol: \\
1) úvod \\
2) literární přehled výskytu kongenitálních chorob prasat a principy molekulárně-genetických metod, využívaných při odhalování těchto chorob - převážně z vědeckých článků v anglickém jazyce\\
3) materiál a metodika - popis vybraného panelu zvířat, popis použitých molekulárně-genetických metod\\
4) výsledky a diskuze - analýza zjištěných výsledků genotypizace u jednotlivých lokusů a porovnání získaných výsledků s výsledky jiných autorů\\
5) závěr - shrnutí zjištěných výsledků, formulace praktických doporučení\\
Při zpracování diplomové práce budou dodržena obvyklá formální pravidla.\\
Seznam doporučené literatury
Seznam odborné literatury:\\
Maak S., Boettcher D., Tetens J., Wensch-Dorendorf M., Nurnberg G., Nimmers K., Swalve H.H., Thaller G. (2009): Identification of candidate genes for congenital splay legin piglets by alternative analysis of DNA microarray data. International Journal of Biology Sciences, 5 (4), 331-337.\\
Reiner G., Hecht W., Buckhardt S., Kohler K., Haushahn P., Reinacher M., Erhardt G. (2008): A complex malformation in a pig: case report and review of the literature. Deutsche Tierarztliche Wochenschrift, 115(5), 194-197.\\
Maak J., Jaesert S., Neumann K., von Lengerleen G. (2003): Characterization of the porcine CDKN3 gene as a potential candidate for congenital splayleg in piglets. Genetics Selection Evolution, 35 (Suppl. 1), S157-S165.\\
Ooi, P.-T.; da Costa, N.; Edgar, J.; Chang, K.-C. (2006): Porcine congenital splayleg is characterised by muscle fibre atrophy associated with relative rise in MAFbx and fall in P311 expression. BMC Veterinary Research, 2:23, 1 - 15.\\
Rothschild, M.F.; Ruvinsky, A. (1998): The Genetics of the Pig. CABI Publishing, 640 pp, ISBN: 978051992297\\
Seznam doporučené literatury
Seznam odborné literatury:\\
Maak S., Boettcher D., Tetens J., Wensch-Dorendorf M., Nurnberg G., Nimmers K., Swalve H.H., Thaller G. (2009): Identification of candidate genes for congenital splay legin piglets by alternative analysis of DNA microarray data. International Journal of Biology Sciences, 5 (4), 331-337.\\
Reiner G., Hecht W., Buckhardt S., Kohler K., Haushahn P., Reinacher M., Erhardt G. (2008): A complex malformation in a pig: case report and review of the literature. Deutsche Tierarztliche Wochenschrift, 115(5), 194-197.\\
Maak J., Jaesert S., Neumann K., von Lengerleen G. (2003): Characterization of the porcine CDKN3 gene as a potential candidate for congenital splayleg in piglets. Genetics Selection Evolution, 35 (Suppl. 1), S157-S165.\\
Ooi, P.-T.; da Costa, N.; Edgar, J.; Chang, K.-C. (2006): Porcine congenital splayleg is characterised by muscle fibre atrophy associated with relative rise in MAFbx and fall in P311 expression. BMC Veterinary Research, 2:23, 1 - 15.\\
Rothschild, M.F.; Ruvinsky, A. (1998): The Genetics of the Pig. CABI Publishing, 640 pp, ISBN: 978051992297\\