Jihočeská univerzita nabízí 11 studijních programů typu joint nebo double degree, z toho tři programy bakalářské a osm navazujících magisterských. Tyto programy byly akreditovány na Filozofické, Pedagogické, Přírodovědecké a Zdravotně sociální fakultě JU. Ekonomická fakulta JU, Fakulta rybářství a ochrany vod JU, Teologická a Zemědělská fakulta JU zatím nemají akreditované studijní programy typu joint/double/multiple degree, nicméně jejich příprava na některých z těchto fakult již také probíhá.
DOUBLE DEGREE
Filozofická fakulta JU:
Název programu: Sciences du langage/Filologie - obor Francouzský jazyk
Partnerské organizace: Université Paris Descartes, Francie
Počátek realizace programu 2009
Délka studia: 4 semestry, z toho 2 semestry na partnerské instituci
Typ programu: navazující magisterský
Partnerské organizace: Université de Lorraine, UFR Sciences Humaines et Sociales, Metz, Francie
Počátek realizace programu: 2014
Délka studia: 4 semestry – 1. semestr na domovské univerzitě studenta, 2. semestr společná výuka na FF JU, 3. semestr společná výuka na Université de Lorraine, 4. semestr dle volby studenta a jeho DP. V průběhu obou ročníků přednášky hostujících profesorů.
Typ programu: magisterský
Partnerské organizace: Università Cattolica del Sacro Cuore (UCSC), Milano, Itálie
Počátek realizace programu: 2015
Délka studia:1.ročník výuka na FF JU v Českých Budějovicích), 2.ročník výuka na UCSC v Miláně
Typ programu: navazující magisterský
Název programu: Dvojí diplom Filologie (románská filologie) - obor Španělský jazyk
Máster Universitario en la Enseňanza de Espaňol como Lengua Extranjera
Máster Universitario en Literatura Espaňola e Hispanoamericana. teoría de la Literatura y Literatura Comparada
Máster Universitario en Gestión del Patrimonio Textual y Humanidades Digitales
Partnerské organizace: Universidad de Salamanca, Španělsko
Počátek realizace programu: 2016
Délka studia: 4 semestry, z toho dva semestry na partnerské univerzitě
Typ programu: navazující magisterský
Přírodovědecká fakulta JU (I)
Název programu: Biochemistry/Biochemie - obor Biological Chemistry
Partnerské organizace: Johannes Kepler Universität Linz, Rakousko
Počátek realizace programu: 2007
Délka studia: 6 semestrů
Typ programu: bakalářský
Přírodovědecká fakulta JU (II)
Název programu: Applied Informatics/Informatika - obor Bioinformatics
Partnerské organizace: Johannes Kepler Universität Linz, Rakousko
Počátek realizace programu: 2012
Délka studia: 6 semestrů
Typ programu: bakalářský
Přírodovědecká fakulta JU (III)
Název programu: Biochemistry/Biochemie - obor Biological Chemistry
Partnerské organizace: Johannes Kepler Universität Linz, Rakousko
Počátek realizace programu: 2010
Délka studia : 5 semestrů
Typ programu: navazující magisterský Studijní programy, organizace studia a vzdělávací činnost
JOINT DEGREE
Ekonomická fakulta
Název programu: Regional and European Project Management
Partnerské organizace: Université de Bretagne-Sud (UBS) ve Francii a Westsächsische Hochschule Zwickau (WHZ) v Německu
Počátek realizace programu: 2015
Délka studia: 4 semestry
Typ programu: navazující magisterský
Pedagogická fakulta
Název programu: European Master in Migration and Intercultural Relations (EMMIR)
Partnerské organizace: University of Oldenburg, Německo (UOL); University of Stavanger, Norsko (UIS);University of Nova Gorica, Slovinsko (UNG); Ahfad; University for Women in Omdurman, Sudan (AUW); Makerere University Kampala, Uganda (MUK); Mbarara University of Science & Technology, Uganda (MUST)
Počátek realizace programu: 2011
Délka studia: 4 semestry
Typ programu: navazující magisterský
Web programu: https://www.emmir.org/