Rektorát
- Kancelář rektora
- Tajemník rektora
- Oddělení vnějších vztahů a komunikace
- Oddělení pro studijní činnost, projekty FRVŠ
- Oddělení pro zahraniční vztahy
- Centrum informačních technologií
- Celoškolské pracoviště
- Jazykové centrum
- Celoškolské pracoviště
- Centrum strategických projektů
- Oddělení pro vědeckou a výzkumnou činnost
- Ekonomický odbor
- Investiční oddělení
- Sekretriát kvestora
- Útvar právní
- Útvar personální
- Útvar interního auditu
- Útvar vnitřní kontroly
- Útvar bezpečnosti práce a požární ochrany
- Útvar správy nemovitostí
- Spisovna a podatelna
- Útvar správy a údržby budov
- Organizační struktura Rektorátu JU + telefonní seznam